中国热带农业科学院研究生导师个人简介

一、基本信息

方永军，男，生于1977年12月，籍贯临安，就职于中国热带农业科学院橡胶研究所，任副研究员。本科毕业于华中农业大学植物保护系，研究生毕业于浙江大学生命科学学院沃森基因组研究院，获生物信息学博士学位。2008年6月入职中科院北京基因组研究所，随后赴沙特阿拉伯从事椰枣基因组测序工作。2012年4月入职中国热带农业科学院橡胶研究所，完成橡胶树基因组测序及叶片发育转录组分析等工作。

二、研究方向简介（不超过200字）

方向一：橡胶树基因组学研究。利用最新测序技术和生物信息学方法，获得高质量橡胶树基因组，并对基因组进行解析。通过基因组进化分析，功能基因演化分析以及转录组分析等手段，探索橡胶树产胶以及乙烯刺激增产的机制。

方向二：乳管胶乳代谢调控研究。胶乳再生是决定橡胶产量的关键环节，利用转录组学，代谢组学及蛋白组学技术相结合研究乳管内胶乳代谢调控网络，深入开展转录因子对胶乳代谢相关基因的表达调控研究。

三、代表性论文

1. Huang Y, Fang Y*, Long X, Liu L, Wang J, Zhu J, Ma Y, Qin Y, Qi J, Hu Xet al:Characterization of the rubber tree metallothionein family reveals a role in mitigating the effects of reactive oxygen species associated with physiological stress.Tree physiology2018.

2. Zhou B, Fang Y, Fan Y, Wang Y, Qi J, Tang C:Expressional characterization of two class I trehalose-6-phosphate synthase genes in Hevea brasiliensis (para rubber tree) suggests a role in rubber production.New Forests2017:1-14.

3. Tang C, Yang M, Fang Y*, Luo Y, Gao S, Xiao X, An Z, Zhou B, Zhang B, Tan Xet al:The rubber tree genome reveals new insights into rubber production and species adaptation.Nat Plants2016,2(6):16073.

4.  Long X, He B, Fang Y, Tang C:Identification and Characterization of the Glucose-6-Phosphate Dehydrogenase Gene Family in the Para Rubber Tree, Hevea brasiliensis.Frontiers in plant science2016,7:215.

5.  Fang Y*, Mei H, Zhou B, Xiao X, Yang M, Huang Y, Long X, Hu S, Tang C:De novo Transcriptome Analysis Reveals Distinct Defense Mechanisms by Young and Mature Leaves of Hevea brasiliensis (Para Rubber Tree).Scientific reports2016,6:33151.

6. Xiao X, Tang C, Fang Y, Yang M, Zhou B, Qi J, Zhang Y:Structure and expression profile of the sucrose synthase gene family in the rubber tree: indicative of roles in stress response and sucrose utilization in the laticifers.The FEBS journal2014,281(1):291-305.

7. Wu H, Fang Y, Yu J, Zhang Z:The quest for a unified view of bacterial land colonization.The ISME journal2014,8(7):1358-1369.

8. Qin Y, Huang Y, Fang Y, Qi J, Tang C:Molecular characterization and expression analysis of the small GTPase ROP members expressed in laticifers of the rubber tree (Hevea brasiliensis).Plant physiology and biochemistry : PPB / Societe francaise de physiologie vegetale2014,74:193-204.

9. Zhang T, Fang Y*, Wang X, Deng X, Zhang X, Hu S, Yu J:The complete chloroplast and mitochondrial genome sequences of Boea hygrometrica: insights into the evolution of plant organellar genomes.PloS one2012,7(1):e30531.

10. Fang Y*, Wu H, Zhang T, Yang M, Yin Y, Pan L, Yu X, Zhang X, Hu S, Al-Mssallem ISet al:A complete sequence and transcriptomic analyses of date palm (Phoenix dactylifera L.) mitochondrial genome.PloS one2012,7(5):e37164.

四、承担科研项目情况（近5年，注明项目类型、名称、执行年限、经费等）

（一）已完成项目

   海南省自然科学基金：割胶促进橡胶合成相关miRNA的鉴定和分析，2014.1-2015.12，2万元

（二）在研项目

国家自然科学基金面上项目：橡胶树乳管代谢调控转录因子的深度发掘与功能分析，2018.1-2021.12，61万元

中国热带农业科学院基本业务费专项：橡胶等主要热带作物功能基因组学研究”创新团队—橡胶基因组精细图绘制与深度分析，2017.1-2021.12，50万元

五、研究生招生专业

博士招生专业：生物技术

硕士招生专业：生物技术

六、联系方式

（一）通讯地址及邮编

海南省儋州市宝岛新村橡胶研究所，571737

（二）联系电话

办公电话：089823300885

手机：

E-mail：fangyj@foxmail.com