近日，中国热科院生物所联合12家科研单位系统回顾了过去20余年植物分子生物学相关生物软件的发展过程，提出研究人员数据挖掘效率提升是亟需关注的重要问题。以TBtools软件十年发展历程为例，总结了植物分子生物学软件研发经验，凝练面向研究者需求的软件开发原则，并进一步展望未来AI-ready生物软件的发展方向。

在过去二十年中，植物分子生物学领域的一个核心挑战在于：大多数湿实验生物学家有限的数据挖掘能力，与生物数据快速增长和日益多样化之间的差距不断扩大。因此提升植物学家的数据探索效率成为一个亟待解决的问题。本研究总结植物生物学200个常用软件，并基于TBtools十年发展经验（图1）提出面向研究者需求的软件设计原则。总体而言，植物分子生物学研究不仅需要算得快、算得准的软件，也需要用得上、用得好的软件。面向未来，生物软件应更好地整合数据、功能与算力，逐步走向真正AI-ready的软件形态。

图1  TBtools用户群体和引文概况

相关成果以“How to make big data accessible to plant biologists and beyond: Ten years of lessons from TBtools”为题发表于《Molecular Plant》。中国热科院生物所冯筠庭助理研究员、环植所吴亚、品资所陈程杰研究员为共同第一作者。华南农业大学园艺学院夏瑞教授、中国热科院生物所谢江辉研究员、品资所王家保研究员和陈程杰研究员为共同通讯作者。该研究得到三亚崖州湾科技城项目、国家自然科学基金、中央级公益性科研院所基本科研业务费等项目资助。

论文链接：https://doi.org/10.1016/j.molp.2026.05.015