近日，中国热科院品资所联合华南农业大学园艺学院构建了油绿苦瓜高质量染色体水平基因组，并基于代表性种质资源初步解析了苦瓜驯化与重要农艺性状的遗传基础。

研究团队以油绿苦瓜品种“Y1745”为材料，组装获得了总长度为327.14 Mb、scaffold N50为23.47 Mb、LAI值为17.85的高质量染色体水平参考基因组。群体基因组分析将来自中国、东南亚和南亚次大陆的192份种质清晰划分为三大遗传类群，揭示了苦瓜复杂的驯化与区域适应历史。通过全基因组关联分析，针对35个农艺性状共鉴定到893个显著关联位点。其中，位于11号染色体上的McWRKY和McFPF1-like 1基因与苦瓜初花期密切相关，10号染色体上的McEXLB1与果实宽度和厚度相关，可能参与果实大小形成。该研究为苦瓜驯化研究和分子育种提供了重要基因组资源，也为早熟、高产和优质新品种选育提供了潜在分子靶标。

苦瓜染色体水平基因组组装及群体遗传结构

该研究成果以“Population genomic analysis reveals genomic variations associated with domestication and key agronomic traits in bitter gourd (Momordica charantia)”为题发表于《Journal of Genetics and Genomics》，品资所牛玉副研究员、广东省农科院设施所王瑞副研究员、华南农业大学硕士研究生王梁等为论文并列第一作者。华南农业大学胡鸣博士后、廖毅教授和品资所杨衍研究员等为论文共同通讯作者。该研究得到海南省重点研发、热带作物生物育种全国重点实验室科研项目以及国家自然科学基金等项目资助。

论文链接：https://doi.org/10.1016/j.jgg.2026.04.017